出版社在研發電子書時也面臨技術上的不確定性。以電子教科書送審為例，局方其中一項要求是電子書能滿足「兼容性」，即電子書須適用於多於一種常用的電腦操作系統（如微軟視窗／安卓／iOS／Mac OS等），然而每個操作系統都有不同版本，版本之間的差異也可以甚大。又，電子書的界面有沒有相應指引，如功能清單應放在上下左右？是隱是顯？